民用医疗普及计划稳步推进的同时，另一项看似“务虚”、实则关乎文明记忆与认同的重要工作，也在木叶高层和总院相关部门的推动下悄然展开——那便是对因姜云清到来而彻底改变的火影世界时间线，进行系统性的梳理、记录与“修正补完”。
历史的记录，从来不仅仅是过去事件的罗列，更承载着一个文明对自身起源、发展与未来的认知与定义。云清的降临，如同一颗投入历史长河的巨石，激起的涟漪早已扩散至方方面面，改变了无数人的命运，也重塑了忍界（尤其是木叶）的发展轨迹。旧有的历史记录，从木叶建村到三次忍界大战，再到近期的诸多事件，其中许多细节、因果关系、乃至重要人物的命运，都已与“现在”发生的现实产生了显着偏差。
若放任这种偏差存在，不加整理与说明，长此以往，必将导致历史认知的混乱、传承的断裂，甚至可能引发对现有政权与理念合法性的质疑。因此，在纲手（分身）、卡卡西以及总院理论部的提议下，一项名为“历史修正与补完工程”的项目正式启动，旨在以当前现实为基准，重新梳理、编纂一部能够清晰反映“医道介入后”忍界变迁的权威史书，并对现有档案、教材、乃至民间传说进行有计划的更新与引导。
云清对此表示支持，并亲自为这项工程定下了基调：“尊重客观发生的事实，阐述变革的内在逻辑，明晰医道理念的积极影响，但同时……对某些过于敏感或可能引起不必要恐慌的‘旧历史’细节（尤其是涉及大筒木、神树污染、以及天道层面冲突的部分），进行有限度的模糊化或分层级保密处理。历史的书写，既要真实，也要服务于当下的稳定与未来的希望。”
工程由总院理论部下属的“历史与文献研究所”具体负责，所长是一位年迈但思维清晰、治学严谨的原木叶档案管理员，辅以数位精通幻术与记忆探查的特别上忍（用于核实某些当事人记忆模糊的细节），以及从各家族抽调的通晓古文和秘闻的学者。纲手（分身）和卡卡西担任总顾问，云清则在关键节点提供最高层级的确认和解读。
工程首先从木叶内部开始，重点梳理几个关键转折点：
一、木叶37-38年，姜云清的崛起与二代火影千手扉间遇袭事件。
旧历史（仅存于极少数高层记忆和绝密档案）：木叶37年，二代火影千手扉间率部与云隐Ab组合交战，遭磁遁陷阱与雷影偷袭，重伤濒死，后经秘密抢救，情况不明，由三代火影猿飞日斩代理政务，直至纲手继任五代。
新历史（需修正补完）：木叶37年，二代火影千手扉间遭云隐Ab组合与疑似内部勾结势力暗算，重伤濒死。关键时刻，身负神秘传承（神农血脉）的医疗天才少年姜云清，以失传禁术“逆命十三针”结合至宝“千年人参”，强行续命，但扉间大人陷入深度生命静滞状态。云清因此损耗十年寿元，其卓越医术与奉献精神震动木叶，获二代火影赏识，亲授飞雷神基础，并引发后续一系列医道改革。纲手公主在其影响与支持下，于木叶38年正式继任五代火影，开启“医道木叶”新时代。扉间大人目前仍在总院深处静滞维护，等待最终救治。
修正要点：突出云清关键作用，明确扉间状态（静滞而非死亡或隐退），将纲手继任与医道兴起直接关联。淡化团藏具体罪行细节（以“内部勾结势力”代指），避免当前政治波动。
二、神树复苏与大筒木入侵事件。
旧历史（民众及中下层忍者完全不知，高层仅知“未知强敌入侵”）：木叶38年前后，发生了一系列异常自然灾害和神秘敌人袭击事件，木叶在五代火影领导下艰难抵御，最终敌人莫名退去，具体细节被列为最高机密。
新历史（分层级记录与披露）：
公开版（载入学校教材及一般史料）：木叶38年，忍界遭遇来自遥远星空的异族（大筒木族）试探性入侵，其力量诡异，能污染大地与生灵。五代火影纲手领导木叶及盟军英勇抗击，同时，医道大宗师姜云清阁下研发出针对性的净化之法与药灵查克拉体系，不仅有效抵御了入侵，更提升了整个忍界的能量层次与环境质量，促使忍界晋升。此战确立了“医道”在对抗未知威胁中的关键地位。
保密版（上忍及以上权限，总院高级研究员可申请调阅）：增加大筒木桃式、金氏名号，提及神树污染能量特性，记载云清联合三大圣地、启用神农鼎、最终击退强敌的具体过程，提及辉夜（嫦曦）的协助及其特殊身份（仅限“来自远古的盟友”）。
绝密版（仅限火影、云清、四圣等极少数核心）：包含全部真相，包括神树起源（被污染的建木）、大筒木寄生文明本质、辉夜真实身份与悲剧、天道善恶念冲突、无量量劫预兆等。此版本作为战略参考，不对外。
三、夕的病情与根源。
旧历史：木叶孤儿院一名叫夕的少女身患奇症，病因不明，长期由医疗班看护。
新历史：夕是早期神树污染能量泄露的受害者之一，体内寄生特殊阴寒死气。其病情是推动云清深入研究污染净化与经络理论的重要案例，也是促使药灵查克拉体系发展、以及后来万界医道网络建立的动因之一。目前夕在总院特别监护下病情稳定，是医道攻克终极疑难的代表性目标。
修正要点：将夕个案与神树污染、医道发展史联系起来，赋予其历史意义，淡化其可能与团藏或大蛇丸实验关联的敏感线索（同样归入“早期污染泄露”）。
四、第七班（鸣人、佐助、小樱）的成长轨迹。
旧历史（原世界线）：波之国外出历练，中忍考试风云，佐助叛逃，追回行动，三年修行，佩恩入侵，五影会谈，第四次忍界大战……
新历史：在云清医道理念的早期影响和纲手成为火影的新环境下，第七班的成长路径发生重大偏移。他们更早接触药灵查克拉与经络理论，鸣人更早与九尾达成初步和解与平衡，佐助更早开始修复自身创伤并探索力量复合，小樱则走上纯粹医道精研之路。他们并未经历原历史中的许多悲剧性事件（如佐助叛逃、自来也战死、佩恩摧毁木叶等），而是在边境巡逻、医疗支援、新型忍术开发、以及对抗零星的污染事件与叛忍活动中成长起来，成为新世代医武结合、理念坚定的代表人物。
修正要点：弱化或删除原历史中的痛苦与分裂事件，强调新环境下积极、健康的成长路径，突出医道理念对年轻一代的塑造作用。
除了关键事件，工程还需处理大量细节：哪些人物的命运被改变（如旗木朔茂被救回，宇智波带土命运改写等）？哪些技术或理论被提前或重新定义（如飞雷神的部分原理被经络理论重新阐释）？哪些原有的矛盾被化解或转化（如宇智波一族与村子的关系因佐助的道路和新医疗福利而改善）？
这是一项浩大且需极其谨慎的工程。历史研究所的学者们经常为了一个用词、一个事件轻重的把握而争论不休。云清和纲手（分身）不得不时常参与仲裁，确保修正后的历史既能反映现实，又不会过于突兀或引发不必要的联想。
与此同时，对现有档案的更新、教材的修订、以及通过民间说书人、戏剧等方式进行的潜移默化的新历史传播，也在同步进行。木叶新建了一座“医道变革纪念馆”，以实物、影像和记录卷轴的形式，向民众展示着“医道木叶”崛起的关键节点和人物事迹。
云清在一次视察纪念馆时，看着那些按照“新历史”陈列的展品——他当年使用的第一套银针、逆命十三针的仿制品（标注：损耗寿元之禁术，非特定条件不可轻用）、早期药灵查克拉提炼装置模型、万界医道网络接入点的示意模型、以及鸣人、佐助、小樱等新生代代表人物的成长记录……心中不由升起一种奇异的感觉。
这个世界的历史，因为他的到来，确实被改写了。无数人的命运轨迹发生了偏转，痛苦被减轻，希望被点燃。而如今，他们又在系统地“确认”这种改变，并将其作为新的正统记录传承下去。
这算不算是某种意义上的“篡改历史”？或许算。但云清认为，如果这种“篡改”带来的是更多的生、更少的死、更强的文明韧性与更光明的未来，那么它就是有意义的。历史本就由胜利者书写，而他的“胜利”，是让生命本身获得更多的尊严与可能性。
当然，他也清楚，完全抹去“旧历史”的痕迹是不可能的。一些影级乃至更强的忍者，或许在冥冥中还对某些“原该发生”的事件有模糊的既视感；某些涉及深层次规则的改变，也可能在时间长河中留下细微的“涟漪”或“疤痕”。这些，或许会在未来以意想不到的方式显现。但至少现在，为新时代确立一个清晰、积极、团结的历史叙事，是必要且紧迫的。
站在纪念馆的窗前，望着外面沐浴在阳光下、充满生机的木叶，云清知道，他为这片土地能做的“奠基”工作，已经基本完成。体系已立，传承有人，民生改善，历史重塑。
是时候，去面对那深海中未知的挑战，为这新生的画卷，补上最后、也是最关键的一块拼图了。